24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1620 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1620  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313028  hitchhiker  0.00000317582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2434  hypothetical protein  72.22 
 
 		 234 aa  360  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0112124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3035  hypothetical protein  77.78 
 
 		 234 aa  357  9e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530845  normal  0.0353116 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2607  hypothetical protein  72.65 
 
 		 234 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230142  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1399  hypothetical protein  67.09 
 
 		 234 aa  328  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.205133  hitchhiker  0.0000000422237 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1589  hypothetical protein  66.24 
 
 		 234 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  unclonable  0.00000000000333402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2789  hypothetical protein  66.24 
 
 		 234 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00603172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1452  hypothetical protein  66.67 
 
 		 234 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.389327  unclonable  0.0000000000496507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3097  hypothetical protein  67.09 
 
 		 234 aa  325  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2769  hypothetical protein  65.81 
 
 		 234 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0144163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2864  hypothetical protein  65.81 
 
 		 234 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.420562 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1464  hypothetical protein  65.81 
 
 		 234 aa  319  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  hitchhiker  0.001985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2468  hypothetical protein  62.39 
 
 		 234 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1521  hypothetical protein  55.98 
 
 		 234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2685  hypothetical protein  57.02 
 
 		 235 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0316068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2176  hypothetical protein  55.56 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00337144  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1655  hypothetical protein  39.06 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3166  hypothetical protein  37.29 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00141395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02710  hypothetical protein  34.32 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0947  hypothetical protein  36.65 
 
 		 188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03123  hypothetical protein  34.45 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002853  hypothetical protein  32.35 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0562  hypothetical protein  33.05 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1770  hypothetical protein  22.98 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>