24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2176 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2176  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00337144  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1399  hypothetical protein  59.83 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.205133  hitchhiker  0.0000000422237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1464  hypothetical protein  60.68 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  hitchhiker  0.001985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1452  hypothetical protein  59.83 
 
 		 234 aa  298  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.389327  unclonable  0.0000000000496507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3097  hypothetical protein  58.55 
 
 		 234 aa  291  9e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2607  hypothetical protein  57.69 
 
 		 234 aa  287  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2468  hypothetical protein  58.55 
 
 		 234 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2434  hypothetical protein  57.26 
 
 		 234 aa  285  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0112124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2769  hypothetical protein  56.41 
 
 		 234 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0144163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2864  hypothetical protein  56.41 
 
 		 234 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.420562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2789  hypothetical protein  55.98 
 
 		 234 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00603172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1589  hypothetical protein  55.56 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  unclonable  0.00000000000333402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1620  hypothetical protein  55.56 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313028  hitchhiker  0.00000317582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1521  hypothetical protein  51.28 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2685  hypothetical protein  53.19 
 
 		 235 aa  254  8e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0316068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3035  hypothetical protein  52.99 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530845  normal  0.0353116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3166  hypothetical protein  36.05 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00141395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1655  hypothetical protein  38.1 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215892  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02710  hypothetical protein  36.4 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0562  hypothetical protein  33.2 
 
 		 243 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002853  hypothetical protein  35.25 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03123  hypothetical protein  31.82 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0947  hypothetical protein  33.51 
 
 		 188 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1770  hypothetical protein  24.42 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>