22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0383 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0383  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 98 aa  200  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2293  Heavy metal transport/detoxification protein  57.3 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0133812 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0577  heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 		 93 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0419156  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1085  heavy metal transport/detoxification protein  41.84 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000218085  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0772  heavy metal transport/detoxification protein  40.43 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000452806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4487  heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206644  normal  0.0472192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2245  heavy metal transport/detoxification protein  32.81 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  26.19 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  30 
 
 		 78 aa  42  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  30.65 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3057  hypothetical protein  40.35 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.726798  decreased coverage  0.000436786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  31.15 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  28.33 
 
 		 68 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  30 
 
 		 64 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 73 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  28.33 
 
 		 97 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>