29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2293 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2293  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
90 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0133812 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0383  heavy metal transport/detoxification protein  57.3 
 
 
98 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0577  heavy metal transport/detoxification protein  55.56 
 
 
93 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0419156  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0772  heavy metal transport/detoxification protein  36.26 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000452806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1085  heavy metal transport/detoxification protein  39.13 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000218085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
759 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
759 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  34.43 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 
68 aa  42.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2245  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4487  heavy metal transport/detoxification protein  30.26 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206644  normal  0.0472192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  31.15 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  31.15 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0449  hypothetical protein  31.15 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.68228e-19 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  29.51 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  40.91 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  40.91 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  40.74 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0311  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
767 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  37.1 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  39.34 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0689  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
694 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  29.51 
 
 
807 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>