24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0577 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0577  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 93 aa  184  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0419156  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0383  heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 		 98 aa  100  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2293  Heavy metal transport/detoxification protein  55.56 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0133812 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1085  heavy metal transport/detoxification protein  47.52 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000218085  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0772  heavy metal transport/detoxification protein  42.55 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000452806  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 793 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  37.5 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  42.03 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4487  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 78 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206644  normal  0.0472192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 735 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 730 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 730 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 1013 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  34.92 
 
 		 733 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3057  hypothetical protein  38.6 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.726798  decreased coverage  0.000436786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 727 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 731 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 731 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>