20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1727 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1727  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  280  5.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.571783  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0502  hypothetical protein  50.42 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.434953 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2446  HIRAN protein  49.41 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.787509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0535  HIRAN protein  42.42 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0734  HIRAN  40.86 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0050  hypothetical protein  39.66 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5861  HIRAN protein  30.67 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3936  hypothetical protein  43.59 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.381249 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1131  hypothetical protein  30.77 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0149196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26720  HIRAN domain-containing protein  32.65 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0286  HIRAN  40.98 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0270  hypothetical protein  26.92 
 
 		 107 aa  47.4  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01800  HIRAN domain-containing protein  35.87 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0079  HIRAN  39.19 
 
 		 333 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0283  HIRAN  29.7 
 
 		 248 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1975  hypothetical protein  41.67 
 
 		 251 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23760  HIRAN domain-containing protein  32.61 
 
 		 227 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  30.77 
 
 		 900 aa  40.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  31.82 
 
 		 972 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>