16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3936 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3936  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  8e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.381249 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0050  hypothetical protein  42.96 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0535  HIRAN protein  43.48 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0283  HIRAN  46.48 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0502  hypothetical protein  35.4 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.434953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5861  HIRAN protein  37.33 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1727  hypothetical protein  43.59 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.571783  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0734  HIRAN  32.18 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1131  hypothetical protein  43.33 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0149196  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  38.81 
 
 		 900 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  33.33 
 
 		 972 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0079  HIRAN  36.36 
 
 		 333 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2446  HIRAN protein  37.97 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.787509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1712  hypothetical protein  32.93 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0035  hypothetical protein  31.4 
 
 		 250 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>