18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0502 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0502  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  250  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.434953 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1727  hypothetical protein  50.42 
 
 		 137 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.571783  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0734  HIRAN  37.23 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2446  HIRAN protein  33.64 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.787509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0535  HIRAN protein  30.51 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0050  hypothetical protein  37.89 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3936  hypothetical protein  35.4 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.381249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5861  HIRAN protein  31.08 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0079  HIRAN  41.46 
 
 		 333 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1131  hypothetical protein  36.17 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0149196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0283  HIRAN  32.26 
 
 		 248 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0286  HIRAN  46.81 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0270  hypothetical protein  27.06 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  36.36 
 
 		 972 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23760  HIRAN domain-containing protein  35.63 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1644  hypothetical protein  29.55 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26720  HIRAN domain-containing protein  32.32 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>