11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01800 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01800  HIRAN domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  233  8e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0270  hypothetical protein  36.45 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1727  hypothetical protein  35.87 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.571783  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0535  HIRAN protein  41.3 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2000  hypothetical protein  35.96 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0233549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0050  hypothetical protein  38.3 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0283  HIRAN  29.81 
 
 		 248 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2446  HIRAN protein  29.47 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.787509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0502  hypothetical protein  31.52 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.434953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5861  HIRAN protein  29.76 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3936  hypothetical protein  36.23 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.381249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>