19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0535 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0535  HIRAN protein  100 
 
 		 131 aa  265  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0050  hypothetical protein  46.56 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3936  hypothetical protein  43.48 
 
 		 135 aa  95.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.381249 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1727  hypothetical protein  42.42 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.571783  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2000  hypothetical protein  35.11 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0233549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0283  HIRAN  31.18 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2446  HIRAN protein  37.96 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.787509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0734  HIRAN  30.25 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0502  hypothetical protein  30.51 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.434953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5861  HIRAN protein  33.78 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1131  hypothetical protein  37.66 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0149196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0270  hypothetical protein  36.92 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26720  HIRAN domain-containing protein  40.74 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  37.31 
 
 		 972 aa  47  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0079  HIRAN  34.75 
 
 		 333 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23760  HIRAN domain-containing protein  36.27 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01800  HIRAN domain-containing protein  41.3 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1712  hypothetical protein  32.1 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  32.31 
 
 		 900 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>