10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0270 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0270  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  220  4e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01800  HIRAN domain-containing protein  36.45 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2446  HIRAN protein  31 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.787509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0535  HIRAN protein  36.92 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0050  hypothetical protein  37.31 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1727  hypothetical protein  26.92 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.571783  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0502  hypothetical protein  27.06 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.434953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.381249 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0734  HIRAN  33.33 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5861  HIRAN protein  25.51 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>