14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0050 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0050  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3936  hypothetical protein  42.96 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.381249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0535  HIRAN protein  46.56 
 
 		 131 aa  99.4  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165002  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1727  hypothetical protein  39.66 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.571783  normal  0.761634 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0734  HIRAN  34.02 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0502  hypothetical protein  37.89 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.434953 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2446  HIRAN protein  42.11 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.787509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0283  HIRAN  31.13 
 
 		 248 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0270  hypothetical protein  37.31 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0079  HIRAN  35.37 
 
 		 333 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1131  hypothetical protein  48 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0149196  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  30.3 
 
 		 900 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23760  HIRAN domain-containing protein  31.71 
 
 		 227 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2000  hypothetical protein  36.84 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0233549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>