256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1531 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1531  putative stress-induced morphogen BolA  100 
 
 
87 aa  176  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0302247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  57.47 
 
 
91 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000171225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  51.76 
 
 
88 aa  88.6  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  48 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  54.05 
 
 
91 aa  83.6  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  50.57 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  56.76 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  46.07 
 
 
95 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  55.71 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  40.96 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  49.32 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  49.32 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  48.84 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  48.86 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5212  transcriptional regulator BolA  59.04 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  48.24 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  46.15 
 
 
83 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  43.18 
 
 
98 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3371  BolA-like protein  58.54 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1443  BolA-like protein  58.54 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  45.45 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1207  BolA-like protein  58.54 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2339  BolA/YrbA family protein  58.54 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2300  BolA/YrbA family protein  58.54 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1934  BolA-like protein  58.54 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1363  BolA family protein  57.83 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  46.75 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2279  putative stress-induced morphogene BolA- like protein  55.81 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0211  BolA family protein  43.96 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000629362  normal  0.330407 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2137  BolA-like protein  58.54 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  46.25 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  41.86 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  45.78 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  44.3 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  45.78 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1899  BolA family protein  56.63 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11230  predicted protein  47.06 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656124  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1921  BolA family protein  54.65 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066107  normal  0.787426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  45.71 
 
 
86 aa  62.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  40.91 
 
 
91 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  50.88 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  50.88 
 
 
82 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1829  BolA family protein  55.42 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367747  normal  0.761747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  40.91 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  43.82 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  45.24 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  45.24 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  37.93 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  40.48 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1934  BolA family protein  59.04 
 
 
102 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139583  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6168  BolA-like protein  59.04 
 
 
102 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1911  BolA family protein  59.04 
 
 
102 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0717  transcriptional regulator BolA  51.76 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.541165  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  41.98 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  38.55 
 
 
91 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1644  bolA protein  53.49 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.448152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  46.43 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  55.1 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  52 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  55.1 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  38.64 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0204  transcriptional regulator BolA  39.62 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  45.71 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  57.14 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  50 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1024  BolA family protein  51.19 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.654546  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  54 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  54 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1481  BolA  47.17 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.491257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  44.59 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0696  BolA family protein  47.17 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00104448  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1880  transcriptional regulator BolA  45.35 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0647  BolA-like protein  33.7 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.81334  normal  0.0407934 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  49.12 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  40.23 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  40.23 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  39.08 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  37.5 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  51.85 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  39.08 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  39.08 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2387  BolA-like protein  48 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  49.12 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  52 
 
 
79 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  52 
 
 
79 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  49.12 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  52 
 
 
79 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  50 
 
 
83 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  52 
 
 
79 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  52 
 
 
79 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  52 
 
 
79 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  39.08 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  42.5 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  52 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  52 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  52 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  52 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  52 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  52 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  52 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>