148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1875 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  100 
 
 		 83 aa  164  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0689  BolA family protein  62.2 
 
 		 85 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1979  stress induced morphogen, BolA  60.98 
 
 		 85 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3078  BolA family protein  59.26 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  50.62 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  50 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  47.95 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  51.9 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  51.9 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  48.05 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11230  predicted protein  46.43 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  51.35 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  54.55 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  44.3 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  48.75 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  55.07 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  45.57 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  44.3 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  44.44 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  47.5 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  49.37 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  47.5 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  47.5 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  50.75 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  45 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  47.5 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  45.33 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  41.89 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  49.35 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  39.74 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  45.12 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  45.12 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  41.25 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  41.25 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  41.1 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  44.93 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  41.25 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  42.67 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  41.1 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  43.84 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  46.38 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  43.28 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  43.59 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  39.73 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  46.27 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  47.89 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  42.67 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  42.86 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1880  transcriptional regulator BolA  45.45 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  38.75 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  49.25 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  53.45 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  38.96 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  43.48 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  46.67 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  40 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000171225  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0930  putative bolA protein  32.43 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.206894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  46.05 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0211  BolA family protein  34.57 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000629362  normal  0.330407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  39.76 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  43.21 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  43.42 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  43.21 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0118  BolA family protein  44.87 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213801  normal  0.0407389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2938  BolA family protein  52.86 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  44.12 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  36.9 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  39.74 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  37.5 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  44.12 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  40 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  37.5 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  37.5 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  37.5 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  37.5 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  37.5 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  37.5 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  37.5 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  37.5 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0647  BolA-like protein  39.24 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.81334  normal  0.0407934 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  41.25 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  36.25 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  41.46 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  38.82 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1531  putative stress-induced morphogen BolA  45.45 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0302247 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  40 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  35 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  35 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  35 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  35 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  35 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  38.75 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2950  transcriptional regulator BolA  43.37 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0082  BolA family protein  37.08 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1803  BolA family protein  43.21 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  35 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  35 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  35 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0204  transcriptional regulator BolA  37.23 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>