203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2030 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  100 
 
 
92 aa  189  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  100 
 
 
92 aa  189  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  77.91 
 
 
93 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  65.88 
 
 
97 aa  114  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  71.05 
 
 
97 aa  114  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2950  transcriptional regulator BolA  72.41 
 
 
88 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  54.95 
 
 
99 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2938  BolA family protein  71.08 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1803  BolA family protein  65.06 
 
 
86 aa  96.7  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  55.56 
 
 
101 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  44.94 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  46.91 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  41.77 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  43.9 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  43.04 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  51.32 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  48 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  47.37 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  42.53 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  47.37 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  47.37 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  41.25 
 
 
104 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  45.68 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  42.68 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  46.84 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  40.74 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  41.25 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  41.25 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  41.25 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  41.25 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  41.25 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  41.25 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  41.25 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  41.25 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  41.25 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  46.15 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  41.25 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  46.05 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  42.53 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  40 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  40 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  40 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  40 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  43.21 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000171225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  44.44 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  46.25 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  40 
 
 
105 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  40 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  40.91 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  41.18 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  41.18 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  45.12 
 
 
83 aa  61.6  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  39.13 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  41.33 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  39.02 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  47.37 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  44.87 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  45.12 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  44.3 
 
 
99 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  38.04 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  38.75 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  38.75 
 
 
108 aa  60.1  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  41.46 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  38.04 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  38.04 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  45.12 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  43.59 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  41.77 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  46.58 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  44.59 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  38.04 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  44.74 
 
 
90 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  44 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0211  BolA family protein  44.3 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000629362  normal  0.330407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  41.46 
 
 
91 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  40.24 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  38.04 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  38.04 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  37.5 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  36.25 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  40.51 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  38.75 
 
 
192 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  36.25 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  36.25 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  40.66 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0920  BolA family protein  40.24 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39406  predicted protein  34.88 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  35.9 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  38.27 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0689  BolA family protein  41.25 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  38.37 
 
 
104 aa  53.9  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  37.5 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1979  stress induced morphogen, BolA  40 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  34.62 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  38.46 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  39.19 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  32.53 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5212  transcriptional regulator BolA  54.79 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2137  BolA-like protein  53.42 
 
 
106 aa  52  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1363  BolA family protein  54.79 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>