233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2938 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2938  BolA family protein  100 
 
 		 93 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  73.91 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  66.67 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  61.96 
 
 		 99 aa  120  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  71.08 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  71.08 
 
 		 92 aa  117  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  64.84 
 
 		 97 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2950  transcriptional regulator BolA  72.29 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1803  BolA family protein  65.06 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  55.7 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  51.25 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  56.94 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  54.32 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  50.63 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  46.75 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  49.4 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  50 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  50 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  52.78 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  52.78 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  46.25 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  52.05 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  46.75 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  48.1 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  50 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  44.3 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  49.43 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  47.56 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  48.1 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  48.1 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  44.71 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  49.33 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  50 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  45.57 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  52.86 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  46.91 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  42.17 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  44.58 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  47.44 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  42.5 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  44.05 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  44.05 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  48.72 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  42.68 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  42.86 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000171225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  41.25 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  40.51 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  45.12 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0118  BolA family protein  45.57 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213801  normal  0.0407389 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  46.05 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  38.82 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  44.3 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5212  transcriptional regulator BolA  50 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  42.68 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11230  predicted protein  44.59 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  41.77 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1363  BolA family protein  48.91 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  41.33 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  48.61 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  39.02 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  41.77 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6168  BolA-like protein  56.58 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  39.77 
 
 		 106 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1911  BolA family protein  56.58 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1934  BolA family protein  56.58 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2339  BolA/YrbA family protein  46.74 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2300  BolA/YrbA family protein  46.74 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424881  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1443  BolA-like protein  46.74 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1207  BolA-like protein  46.74 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  45.83 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1829  BolA family protein  51.32 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367747  normal  0.761747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  39.02 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1899  BolA family protein  51.32 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0082  BolA family protein  44.58 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1934  BolA-like protein  46.74 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  47.22 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3371  BolA-like protein  46.74 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1745  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  40.24 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3067  transcriptional regulator BolA  47.62 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  35.37 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  39.47 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  41.67 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02420  conserved hypothetical protein  34.83 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  39.56 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0211  BolA family protein  42.47 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000629362  normal  0.330407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0689  BolA family protein  44.59 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  38.16 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  38.16 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  38.16 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  40.24 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  38.16 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  40.24 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2137  BolA-like protein  50 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  38.16 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  38.16 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  38.16 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  38.16 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1500  BolA family protein  51.28 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.029191  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  38.16 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>