244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2687 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  100 
 
 
91 aa  184  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  68.18 
 
 
107 aa  120  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  63.22 
 
 
96 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  61.11 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  57.3 
 
 
95 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  58.97 
 
 
105 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  53.93 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  48.31 
 
 
94 aa  85.5  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  45.45 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  48.1 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  48.81 
 
 
91 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000171225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  53.01 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0717  transcriptional regulator BolA  62.07 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.541165  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  46.51 
 
 
98 aa  77  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  43.53 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  50 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0118  BolA family protein  47.31 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213801  normal  0.0407389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  44.05 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11230  predicted protein  48.81 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656124  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1644  bolA protein  55.17 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.448152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  43.21 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  46.05 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  44.05 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  41.3 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  44.05 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  41.67 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  41.67 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  47.5 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  41.67 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  44.05 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1531  putative stress-induced morphogen BolA  54.05 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0302247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  44.3 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  38 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  41.57 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  49.37 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  34.78 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1459  BolA family protein  53.41 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102001  hitchhiker  0.00000045086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  42.53 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  42.7 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1500  BolA family protein  55.29 
 
 
90 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.029191  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  41.67 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  45.05 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  46.05 
 
 
101 aa  62.8  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  43.9 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  42.35 
 
 
102 aa  62  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  42.7 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  41.18 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  41.18 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  42.35 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  39.29 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  46.15 
 
 
84 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3078  BolA family protein  44.87 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1745  hypothetical protein  55.29 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485281  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  42.53 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  42.31 
 
 
98 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  39.29 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  41.18 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  42.17 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  41.18 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  41.18 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0689  BolA family protein  44.87 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  44.94 
 
 
90 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  43.75 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  42.17 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  37.35 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02420  conserved hypothetical protein  38.82 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2387  BolA-like protein  46.51 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  42.17 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1979  stress induced morphogen, BolA  43.59 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  55.1 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  42.68 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  38.1 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0204  transcriptional regulator BolA  36.63 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  41.46 
 
 
92 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  49.25 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  41.46 
 
 
92 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  39.02 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  40.24 
 
 
95 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  44.78 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  34.12 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  38.1 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  34.12 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  40.96 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  34.12 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  38.55 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0665  BolA family protein  44.3 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0782  BolA family protein  35.29 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39406  predicted protein  36.36 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0761319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>