160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0646 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  100 
 
 
84 aa  168  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  62.65 
 
 
85 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  58.23 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  53.01 
 
 
86 aa  86.7  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1979  stress induced morphogen, BolA  53.01 
 
 
85 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  50 
 
 
83 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3078  BolA family protein  54.22 
 
 
85 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  54.43 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  53.75 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0689  BolA family protein  51.81 
 
 
85 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  49.38 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  46.91 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  55.26 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  46.91 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0647  BolA-like protein  48.1 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.81334  normal  0.0407934 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  48.19 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  50.63 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  50.63 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  46.91 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  46.84 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  47.5 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0082  BolA family protein  45.88 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  50.67 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  43.82 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  43.82 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  45.45 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  41.46 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11230  predicted protein  41.25 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  45.12 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  43.21 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3067  transcriptional regulator BolA  41.11 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  44.44 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  43.37 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  47.37 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  41.25 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  44.58 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  41.77 
 
 
97 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  46.15 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  43.21 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  45.68 
 
 
105 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  43.04 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  40.45 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  41.46 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  42.17 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  46.58 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  46.58 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  39.51 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  42.5 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  40 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  40.23 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  41.77 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  40.74 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  40.74 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  40.74 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  40.74 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  40.74 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  40.74 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  40.74 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  40.74 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  40.74 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  40.51 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  39.51 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  40.51 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  37.93 
 
 
98 aa  53.9  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  40.51 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  40.51 
 
 
104 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  40.74 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  37.5 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  39.51 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  39.24 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0118  BolA family protein  40.48 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213801  normal  0.0407389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  37.5 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  37.04 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  36.71 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  36.71 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  36.71 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  34.94 
 
 
108 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0204  transcriptional regulator BolA  34.69 
 
 
114 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  39.29 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  39.51 
 
 
104 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  40.74 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1745  hypothetical protein  49.37 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485281  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  46.55 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  37.04 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0184  BolA-like protein  26.19 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  41.67 
 
 
94 aa  50.8  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  39.71 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2950  transcriptional regulator BolA  43.59 
 
 
88 aa  50.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  33.33 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  38.27 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  33.33 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0930  putative bolA protein  26.25 
 
 
96 aa  49.7  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.206894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  38.27 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  33.33 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  41.94 
 
 
88 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>