230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1203 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  100 
 
 		 85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  69.23 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3078  BolA family protein  63.1 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1979  stress induced morphogen, BolA  61.45 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0689  BolA family protein  61.45 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  62.65 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  52.5 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  56.63 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  51.22 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  50 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  50.59 
 
 		 101 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  50.62 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  50.59 
 
 		 89 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  47.06 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  45.12 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  54.55 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  52.33 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  45.57 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  52.56 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  50 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  43.33 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  43.33 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  45.35 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  46.51 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  42.68 
 
 		 92 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  45.12 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  50.6 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  50 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  44.19 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  41.86 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  47.37 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  46.84 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  44.44 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  51.25 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  46.05 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0082  BolA family protein  41.86 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  45.68 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  41.11 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  40.51 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  40.51 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  44.3 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  40.51 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  43.75 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  47.69 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  43.75 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0647  BolA-like protein  45.24 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.81334  normal  0.0407934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  45 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  41.98 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  41.46 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  43.21 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  44.3 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  40.7 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  43.04 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  41.98 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  38.55 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  41.98 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  41.98 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  41.98 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  44.74 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  45.33 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  41.98 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  44.74 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  41.77 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3067  transcriptional regulator BolA  38.71 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  48.39 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  43.21 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  41.77 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  40.74 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  41.33 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  40.74 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26832  predicted protein  47.62 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.28154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0204  transcriptional regulator BolA  33.67 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0118  BolA family protein  39.53 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213801  normal  0.0407389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  40.74 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  40.74 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  40.74 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  40.74 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  40.74 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11230  predicted protein  41.43 
 
 		 93 aa  60.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  37.97 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  37.04 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  44.59 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  37.33 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  39.51 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  36.71 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  44.59 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2137  BolA-like protein  49.33 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  39.51 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  39.51 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  39.74 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  37.04 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  36.71 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  41.98 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02420  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  37.66 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>