More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1745 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1745  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  189  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1500  BolA family protein  86.17 
 
 		 90 aa  129  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.029191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1459  BolA family protein  84.04 
 
 		 90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102001  hitchhiker  0.00000045086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  58.33 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  53.09 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000171225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  57.14 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  55.68 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  55.29 
 
 		 91 aa  87  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1393  transcriptional regulator BolA  66.3 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52219  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  56.1 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  54.55 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  54.88 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1867  transcriptional regulator BolA  66.3 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.991732  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  53.41 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  53.01 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  55 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  56.1 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  49.43 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  50 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  52.33 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  53.75 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  45 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  50 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1363  BolA family protein  64.44 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1829  BolA family protein  61.96 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367747  normal  0.761747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  48.31 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  51.28 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  50.6 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  49.43 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  44.79 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1899  BolA family protein  60.87 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  46.51 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  52.5 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  49.41 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  54.55 
 
 		 89 aa  73.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  47.19 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2137  BolA-like protein  63.33 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  50 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  52.27 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  46.51 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0118  BolA family protein  46.34 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213801  normal  0.0407389 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  47.19 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5212  transcriptional regulator BolA  61.11 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  45.88 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1443  BolA-like protein  62.22 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2300  BolA/YrbA family protein  62.22 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2339  BolA/YrbA family protein  62.22 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1934  BolA-like protein  62.22 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1207  BolA-like protein  62.22 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3371  BolA-like protein  62.22 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0647  BolA-like protein  45.05 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.81334  normal  0.0407934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  46.59 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  53.16 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  47.73 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  46.59 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  47.19 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  48.1 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  46.34 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  48 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  48 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  48.72 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  44.71 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1921  BolA family protein  56.99 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066107  normal  0.787426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1934  BolA family protein  64.2 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2279  putative stress-induced morphogene BolA- like protein  56.99 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6168  BolA-like protein  64.2 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1911  BolA family protein  64.2 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2387  BolA-like protein  51.11 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1024  BolA family protein  57.14 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.654546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  42.35 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02420  conserved hypothetical protein  39.13 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  42.35 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  42.35 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  42.35 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  42.35 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  42.35 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  42.35 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  42.35 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  43.53 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  42.35 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  42.35 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  41.18 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  41.18 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  41.18 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  41.18 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  41.18 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0013  BolA family protein  39.76 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0874253  normal  0.885333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0012  BolA family protein  39.76 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  42.35 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  44.05 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  44.87 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1644  bolA protein  53.01 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.448152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5884  hypothetical protein  40.74 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206517  normal  0.559405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2938  BolA family protein  47.19 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  41.18 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  48.05 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4089  BolA family protein  41.46 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  36.96 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  35.29 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11230  predicted protein  44.87 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>