198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0874 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  100 
 
 
94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0974  BolA family protein  66.67 
 
 
94 aa  99.4  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  48.31 
 
 
91 aa  85.5  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  44.58 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  52.5 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  42.7 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  48.15 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  45.88 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  48.15 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  47.3 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  41.86 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2113  BolA-like protein  44.59 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000171225  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  43.21 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  46.15 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  45.12 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  47.44 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  39.76 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  43.37 
 
 
98 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  37.65 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  37.36 
 
 
101 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  43.37 
 
 
91 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  44.3 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  44.16 
 
 
97 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  45.71 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  43.66 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  39.76 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  43.66 
 
 
119 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  40.96 
 
 
98 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  42.11 
 
 
96 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1531  putative stress-induced morphogen BolA  48 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0302247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  41.77 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  39.33 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  44.87 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  44 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  42.31 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  44 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  35.42 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  40.51 
 
 
93 aa  57.8  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  42.86 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0717  transcriptional regulator BolA  47.13 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.541165  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  39.24 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  37.66 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1459  BolA family protein  55.84 
 
 
90 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102001  hitchhiker  0.00000045086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1500  BolA family protein  55.84 
 
 
90 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.029191  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  32.08 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  32.38 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  37.5 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  32.67 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11230  predicted protein  45.33 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656124  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  35.8 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  39.24 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  36.14 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  45.59 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  35.63 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2938  BolA family protein  46.25 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1745  hypothetical protein  54.55 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485281  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  33 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  44.9 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  36.26 
 
 
105 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  40 
 
 
79 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  41.46 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  41.67 
 
 
84 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  38.33 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0696  BolA family protein  41.51 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00104448  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1481  BolA  41.51 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.491257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  39.53 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  31.03 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2387  BolA-like protein  37.93 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  39.71 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  42.65 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  35.8 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  36.78 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3598  BolA family protein  40.43 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00692216  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  35.8 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2050  BolA family protein  42.31 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  37.14 
 
 
101 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0647  BolA-like protein  37.35 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.81334  normal  0.0407934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  37.84 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0118  BolA family protein  36.84 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213801  normal  0.0407389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  32.1 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  32.5 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  40.82 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  37.14 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  40.82 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  36.99 
 
 
95 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  35.8 
 
 
106 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10771  BolA-like protein  30.59 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.42913 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  42.11 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  34.12 
 
 
99 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  27.78 
 
 
127 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  33.33 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  38.33 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  33.33 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5212  transcriptional regulator BolA  40.7 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  32.47 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  39.34 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1822  BolA family protein  38.89 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  32.5 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  32.5 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  34.07 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>