48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0725 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0725  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  124  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.681325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3017  hemin transport system, hemin uptake protein  56.52 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2337  hemin uptake protein-like protein  62.16 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3268  hemin transport system, hemin uptake protein  55.56 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202913  hitchhiker  0.00689409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1072  hypothetical protein  49.09 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.17261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2571  hypothetical protein  49.12 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0219978  hitchhiker  0.000328028 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1441  hemin transport system, hemin uptake protein  50 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2204  hypothetical protein  44.83 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5873  hypothetical protein  44.83 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1439  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2122  hypothetical protein  44.83 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.539553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2243  hypothetical protein  44.83 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1401  hypothetical protein  46.15 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.036318  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3147  hypothetical protein  48.08 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766955  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5533  hypothetical protein  43.1 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2229  hypothetical protein  43.1 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.955597 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1511  hypothetical protein  56.76 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00462794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1926  hypothetical protein  56.76 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2030  hypothetical protein  56.76 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.960764  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3071  hypothetical protein  58.33 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0673605  normal  0.301271 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2094  hypothetical protein  56.76 
 
 		 48 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0611  hypothetical protein  56.76 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0513  hypothetical protein  56.76 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0778  hypothetical protein  56.76 
 
 		 48 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1568  hypothetical protein  55.56 
 
 		 48 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.652462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0644  hypothetical protein  41.82 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2409  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.472359  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1966  putative hemin uptake protein  42.37 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4165  hypothetical protein  54.05 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1795  putative hemin uptake protein  54.05 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311499  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2119  putative hemin uptake protein  54.05 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.241554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1952  hypothetical protein  54.05 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3515  hypothetical protein  42.31 
 
 		 53 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2238  hypothetical protein  47.92 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3054  hypothetical protein  48.65 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1930  hypothetical protein  54.05 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1804  hypothetical protein  54.05 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3314  hypothetical protein  44.9 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  0.549861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0165  hypothetical protein  55.56 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2351  hypothetical protein  58.33 
 
 		 69 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.346428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3888  hemin uptake protein  39.68 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000029991  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3622  hypothetical protein  43.86 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3800  hemin uptake protein  39.68 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0303945  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04672  hypothetical protein  39.29 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0651  hemin uptake protein  39.68 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.179032 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1605  hypothetical protein  45 
 
 		 54 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000330162  hitchhiker  0.0000142519 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0386  hypothetical protein  47.22 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1789  hypothetical protein  48.78 
 
 		 41 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00105289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>