28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3622 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3622  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  190  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1441  hemin transport system, hemin uptake protein  65.85 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3268  hemin transport system, hemin uptake protein  46.03 
 
 
60 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202913  hitchhiker  0.00689409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2337  hemin uptake protein-like protein  67.65 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3017  hemin transport system, hemin uptake protein  60 
 
 
59 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116465  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3054  hypothetical protein  40.58 
 
 
70 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0186  hypothetical protein  37.04 
 
 
80 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.20305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1804  hypothetical protein  64.71 
 
 
70 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0165  hypothetical protein  61.76 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3071  hypothetical protein  55.88 
 
 
75 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0673605  normal  0.301271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2119  putative hemin uptake protein  47.37 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.241554  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2412  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2351  hypothetical protein  58.82 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.346428  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1966  putative hemin uptake protein  55.88 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1970  hypothetical protein  55.88 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3314  hypothetical protein  55.88 
 
 
90 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  0.549861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1439  hypothetical protein  36.99 
 
 
69 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1795  putative hemin uptake protein  52.94 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311499  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1508  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.265609  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0386  hypothetical protein  51.22 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1687  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579492  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0725  hypothetical protein  43.86 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.681325  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2571  hypothetical protein  43.33 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0219978  hitchhiker  0.000328028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2409  hypothetical protein  34.72 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.472359  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4165  hypothetical protein  55.88 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2122  hypothetical protein  38.98 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.539553  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1568  hypothetical protein  50 
 
 
48 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.652462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2243  hypothetical protein  38.98 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>