17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0186 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0186  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2351  hypothetical protein  46.27 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.346428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1930  hypothetical protein  62.16 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1970  hypothetical protein  64.71 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2412  hypothetical protein  43.1 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3622  hypothetical protein  37.04 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0165  hypothetical protein  47.27 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4550  hypothetical protein  47.46 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4587  hypothetical protein  58.33 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.267053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1789  hypothetical protein  54.05 
 
 		 41 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00105289  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4165  hypothetical protein  52.38 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1568  hypothetical protein  51.11 
 
 		 48 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.652462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0644  hypothetical protein  43.4 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1441  hemin transport system, hemin uptake protein  52.78 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04672  hypothetical protein  46.51 
 
 		 74 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3268  hemin transport system, hemin uptake protein  55.56 
 
 		 60 aa  40.8  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202913  hitchhiker  0.00689409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3017  hemin transport system, hemin uptake protein  55.56 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>