20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0165 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0165  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2351  hypothetical protein  76.92 
 
 		 69 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.346428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2412  hypothetical protein  73.68 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1970  hypothetical protein  59.02 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4550  hypothetical protein  57.78 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1930  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1441  hemin transport system, hemin uptake protein  46.67 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1605  hypothetical protein  52.08 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000330162  hitchhiker  0.0000142519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0186  hypothetical protein  47.27 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1508  hypothetical protein  58.33 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.265609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1687  hypothetical protein  58.33 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4587  hypothetical protein  46.55 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.267053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3622  hypothetical protein  61.76 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2337  hemin uptake protein-like protein  42.19 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3017  hemin transport system, hemin uptake protein  38.46 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3054  hypothetical protein  39.68 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3268  hemin transport system, hemin uptake protein  38.46 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202913  hitchhiker  0.00689409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0725  hypothetical protein  55.56 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.681325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3132  hypothetical protein  61.29 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10143  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0386  hypothetical protein  36.92 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>