19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1930 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1930  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2412  hypothetical protein  53.57 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0165  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2351  hypothetical protein  66.67 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.346428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1970  hypothetical protein  48.28 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1789  hypothetical protein  59.46 
 
 		 41 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00105289  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0644  hypothetical protein  67.57 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4587  hypothetical protein  47.17 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.267053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04672  hypothetical protein  64.86 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0186  hypothetical protein  62.16 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20305 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0725  hypothetical protein  54.05 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.681325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3515  hypothetical protein  45.83 
 
 		 53 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1605  hypothetical protein  56.76 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000330162  hitchhiker  0.0000142519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4550  hypothetical protein  58.82 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0864  hypothetical protein  42.86 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0882305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1441  hemin transport system, hemin uptake protein  48.65 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1687  hypothetical protein  38.98 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1508  hypothetical protein  38.98 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.265609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1966  putative hemin uptake protein  35.94 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>