44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1795 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1795  putative hemin uptake protein  100 
 
 		 93 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311499  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2119  putative hemin uptake protein  80.65 
 
 		 102 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.241554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1966  putative hemin uptake protein  67.74 
 
 		 92 aa  123  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2409  hypothetical protein  46.27 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.472359  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2280  hypothetical protein  46.05 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.099286  normal  0.012647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5533  hypothetical protein  61.54 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2229  hypothetical protein  58.97 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.955597 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1511  hypothetical protein  60.53 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00462794  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0778  hypothetical protein  51.02 
 
 		 48 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2094  hypothetical protein  51.02 
 
 		 48 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1926  hypothetical protein  60.53 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2238  hypothetical protein  41.05 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2030  hypothetical protein  45.31 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.960764  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0611  hypothetical protein  60.53 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0513  hypothetical protein  60.53 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2571  hypothetical protein  43.59 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0219978  hitchhiker  0.000328028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1401  hypothetical protein  43.21 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.036318  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1439  hypothetical protein  44.78 
 
 		 69 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5873  hypothetical protein  56.41 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2204  hypothetical protein  56.41 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3071  hypothetical protein  63.89 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0673605  normal  0.301271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1072  hypothetical protein  56.41 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.17261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3268  hemin transport system, hemin uptake protein  57.89 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202913  hitchhiker  0.00689409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1952  hypothetical protein  44.29 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3054  hypothetical protein  51.16 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2337  hemin uptake protein-like protein  52.63 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2122  hypothetical protein  53.85 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.539553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3314  hypothetical protein  58.33 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  0.549861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2243  hypothetical protein  53.85 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3147  hypothetical protein  57.89 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766955  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1804  hypothetical protein  54.05 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3017  hemin transport system, hemin uptake protein  55.26 
 
 		 59 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0725  hypothetical protein  54.05 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.681325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3515  hypothetical protein  51.35 
 
 		 53 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4165  hypothetical protein  40.3 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1441  hemin transport system, hemin uptake protein  32.31 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3622  hypothetical protein  52.94 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4625  hypothetical protein  58.82 
 
 		 73 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000865793 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1117  hypothetical protein  45.1 
 
 		 58 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.180887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0444  Hemin uptake protein hemP  46.51 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.0000183054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0864  hypothetical protein  55.26 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0882305  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1605  hypothetical protein  54.05 
 
 		 54 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000330162  hitchhiker  0.0000142519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1742  hypothetical protein  40.68 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00135629  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0186  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20305 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>