27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2280 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2280  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  213  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.099286  normal  0.012647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2238  hypothetical protein  75 
 
 		 107 aa  150  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1795  putative hemin uptake protein  55.1 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311499  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2119  putative hemin uptake protein  60.61 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.241554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1966  putative hemin uptake protein  52.08 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3147  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766955  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1952  hypothetical protein  45.65 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2094  hypothetical protein  50 
 
 		 48 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1072  hypothetical protein  42.37 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.17261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0778  hypothetical protein  50 
 
 		 48 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0513  hypothetical protein  52.78 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0611  hypothetical protein  52.78 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2030  hypothetical protein  52.78 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.960764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5533  hypothetical protein  52.78 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1926  hypothetical protein  52.78 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1511  hypothetical protein  52.78 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00462794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2243  hypothetical protein  40.68 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2122  hypothetical protein  40.68 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.539553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1401  hypothetical protein  46.34 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.036318  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2204  hypothetical protein  40.68 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5873  hypothetical protein  40.68 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2229  hypothetical protein  40.68 
 
 		 81 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.955597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3314  hypothetical protein  45.65 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  0.549861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1804  hypothetical protein  45.24 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2409  hypothetical protein  38.18 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.472359  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1439  hypothetical protein  38.18 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3515  hypothetical protein  50 
 
 		 53 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>