47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5873 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5873  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2204  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2229  hypothetical protein  98.77 
 
 
81 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.955597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1072  hypothetical protein  90.12 
 
 
81 aa  147  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.17261  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5533  hypothetical protein  80.72 
 
 
83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2122  hypothetical protein  87.3 
 
 
81 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.539553  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2243  hypothetical protein  87.3 
 
 
81 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1511  hypothetical protein  71.26 
 
 
87 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00462794  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1926  hypothetical protein  68.97 
 
 
87 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2030  hypothetical protein  68.18 
 
 
88 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.960764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1401  hypothetical protein  64.37 
 
 
86 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.036318  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3147  hypothetical protein  60.92 
 
 
86 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766955  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0513  hypothetical protein  67.11 
 
 
76 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0611  hypothetical protein  67.11 
 
 
76 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1952  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313889  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2094  hypothetical protein  81.25 
 
 
48 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0778  hypothetical protein  81.25 
 
 
48 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1439  hypothetical protein  43.94 
 
 
69 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3071  hypothetical protein  45.31 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0673605  normal  0.301271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2409  hypothetical protein  43.94 
 
 
69 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.472359  normal  0.762343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3054  hypothetical protein  44.44 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2571  hypothetical protein  48.28 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0219978  hitchhiker  0.000328028 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0725  hypothetical protein  44.83 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.681325  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1795  putative hemin uptake protein  56.41 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311499  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2119  putative hemin uptake protein  56.41 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.241554  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1966  putative hemin uptake protein  44.44 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3314  hypothetical protein  58.33 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  0.549861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0864  hypothetical protein  50 
 
 
63 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0882305  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0386  hypothetical protein  48.98 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1804  hypothetical protein  56.76 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2280  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.099286  normal  0.012647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3017  hemin transport system, hemin uptake protein  48 
 
 
59 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116465  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2337  hemin uptake protein-like protein  47.62 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2238  hypothetical protein  39.47 
 
 
107 aa  43.9  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4625  hypothetical protein  55.56 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000865793 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1117  hypothetical protein  55.56 
 
 
58 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.180887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3888  hemin uptake protein  55.56 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000029991  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0651  hemin uptake protein  55.56 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.179032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3800  hemin uptake protein  55.56 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0303945  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1441  hypothetical protein  51.22 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0455717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1827  hypothetical protein  51.22 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1999  hypothetical protein  51.22 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.311882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1742  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00135629  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1475  hypothetical protein  51.22 
 
 
60 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.909497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1457  hypothetical protein  51.22 
 
 
60 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.989072 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4165  hypothetical protein  51.28 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3268  hemin transport system, hemin uptake protein  48.78 
 
 
60 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202913  hitchhiker  0.00689409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>