26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0651 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0651  hemin uptake protein  100 
 
 
63 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.179032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3888  hemin uptake protein  98.41 
 
 
63 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000029991  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3800  hemin uptake protein  98.41 
 
 
63 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0303945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2170  hypothetical protein  50.79 
 
 
61 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0707676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1401  hypothetical protein  58.33 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.036318  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3147  hypothetical protein  58.33 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766955  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1742  hypothetical protein  58.33 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00135629  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0444  Hemin uptake protein hemP  51.28 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.0000183054  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1966  putative hemin uptake protein  45 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2122  hypothetical protein  48 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.539553  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2243  hypothetical protein  48 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1072  hypothetical protein  55.56 
 
 
81 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.17261  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2204  hypothetical protein  55.56 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5873  hypothetical protein  55.56 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3515  hypothetical protein  44.44 
 
 
53 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0725  hypothetical protein  39.68 
 
 
60 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.681325  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1441  hypothetical protein  46.94 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0455717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1827  hypothetical protein  46.94 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1999  hypothetical protein  46.94 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.311882 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1923  hypothetical protein  52.78 
 
 
63 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.167595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01674  hypothetical protein  52.78 
 
 
63 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.151752  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1785  hypothetical protein  52.78 
 
 
63 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1457  hypothetical protein  46.94 
 
 
60 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.989072 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1475  hypothetical protein  46.94 
 
 
60 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.909497 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01663  hypothetical protein  52.78 
 
 
63 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0935072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1937  conserved hypothetical protein  52.78 
 
 
63 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>