19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1937 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2423  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1937  conserved hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01663  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0935072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1923  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.167595  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1785  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01674  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.151752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1926  hypothetical protein  98.41 
 
 
63 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1485  hypothetical protein  96.83 
 
 
72 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1909  hypothetical protein  96.83 
 
 
63 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1441  hypothetical protein  60.32 
 
 
63 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0455717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1827  hypothetical protein  60.32 
 
 
63 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1999  hypothetical protein  60.32 
 
 
63 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.311882 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1457  hypothetical protein  62.71 
 
 
60 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.989072 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1475  hypothetical protein  62.71 
 
 
60 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.909497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1742  hypothetical protein  54.69 
 
 
62 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00135629  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0864  hypothetical protein  44.64 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0882305  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3515  hypothetical protein  45.28 
 
 
53 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2170  hypothetical protein  61.76 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0707676 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0651  hemin uptake protein  52.78 
 
 
63 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.179032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>