31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1457 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1999  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  123  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.311882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1475  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.909497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1457  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.989072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1827  hypothetical protein  98.33 
 
 
63 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1441  hypothetical protein  98.33 
 
 
63 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0455717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1785  hypothetical protein  62.71 
 
 
63 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01663  hypothetical protein  62.71 
 
 
63 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0935072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2423  hypothetical protein  62.71 
 
 
72 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1923  hypothetical protein  62.71 
 
 
63 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.167595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01674  hypothetical protein  62.71 
 
 
63 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.151752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1937  conserved hypothetical protein  62.71 
 
 
63 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1909  hypothetical protein  62.71 
 
 
63 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1926  hypothetical protein  62.71 
 
 
63 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1485  hypothetical protein  61.02 
 
 
72 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1742  hypothetical protein  56.67 
 
 
62 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00135629  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0864  hypothetical protein  44.23 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0882305  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2170  hypothetical protein  60 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0707676 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1511  hypothetical protein  53.66 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00462794  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0778  hypothetical protein  53.66 
 
 
48 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2094  hypothetical protein  53.66 
 
 
48 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5533  hypothetical protein  53.66 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1926  hypothetical protein  53.85 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0513  hypothetical protein  53.85 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0611  hypothetical protein  53.85 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2030  hypothetical protein  53.85 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.960764  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2229  hypothetical protein  51.22 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.955597 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5873  hypothetical protein  51.22 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2204  hypothetical protein  51.22 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3132  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10143  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3147  hypothetical protein  55 
 
 
86 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766955  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0651  hemin uptake protein  46.94 
 
 
63 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.179032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>