25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2170 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2170  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  127  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0707676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3800  hemin uptake protein  50.79 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0303945  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0651  hemin uptake protein  50.79 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.179032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3888  hemin uptake protein  50.79 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000029991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1742  hypothetical protein  65.71 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00135629  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1999  hypothetical protein  60 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.311882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1827  hypothetical protein  60 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1441  hypothetical protein  60 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0455717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2571  hypothetical protein  41.51 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0219978  hitchhiker  0.000328028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1475  hypothetical protein  60 
 
 
60 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.909497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1457  hypothetical protein  60 
 
 
60 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.989072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1952  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313889  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01663  hypothetical protein  61.76 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0935072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01674  hypothetical protein  61.76 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.151752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1909  hypothetical protein  61.76 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1926  hypothetical protein  61.76 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1923  hypothetical protein  61.76 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.167595  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1785  hypothetical protein  61.76 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3314  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  0.549861 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1937  conserved hypothetical protein  61.76 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1485  hypothetical protein  61.76 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0386  hypothetical protein  52.63 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3054  hypothetical protein  37.29 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2423  hypothetical protein  61.76 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1117  hypothetical protein  42.37 
 
 
58 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.180887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>