15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3888 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3800  hemin uptake protein  100 
 
 		 63 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0303945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3888  hemin uptake protein  100 
 
 		 63 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000029991  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0651  hemin uptake protein  98.41 
 
 		 63 aa  130  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.179032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2170  hypothetical protein  50.79 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0707676 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3147  hypothetical protein  58.33 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766955  normal  0.490108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1742  hypothetical protein  58.33 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00135629  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1401  hypothetical protein  58.33 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.036318  normal  0.109047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1966  putative hemin uptake protein  42.86 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0444  Hemin uptake protein hemP  51.28 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.0000183054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2243  hypothetical protein  48 
 
 		 81 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1072  hypothetical protein  55.56 
 
 		 81 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.17261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2122  hypothetical protein  48 
 
 		 81 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.539553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0725  hypothetical protein  39.68 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.681325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5873  hypothetical protein  55.56 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2204  hypothetical protein  55.56 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>