More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0656 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0656  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
486 aa  989    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2073  leucyl aminopeptidase  53.81 
 
 
485 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.143988  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1961  leucyl aminopeptidase  52.04 
 
 
494 aa  504  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2961  peptidase M17, leucyl aminopeptidase, C-terminal  54.08 
 
 
490 aa  484  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  normal  0.769168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  42.22 
 
 
500 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  39.32 
 
 
499 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3886  Leucyl aminopeptidase  38.12 
 
 
524 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.384144  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  37.75 
 
 
500 aa  204  4e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  35.87 
 
 
499 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  36.36 
 
 
500 aa  202  1.9999999999999998e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  39.46 
 
 
497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  39.46 
 
 
497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  40.07 
 
 
488 aa  200  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  39.08 
 
 
497 aa  200  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  38.08 
 
 
500 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  36.84 
 
 
500 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  37.46 
 
 
497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  38.46 
 
 
539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  37.16 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  37.04 
 
 
500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0849  Leucyl aminopeptidase  38.75 
 
 
491 aa  196  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.531813  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  37.69 
 
 
496 aa  196  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4642  Leucyl aminopeptidase  40.79 
 
 
480 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  37.99 
 
 
495 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  39.13 
 
 
487 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  37.7 
 
 
492 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  37.46 
 
 
500 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  40.07 
 
 
496 aa  193  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  37.63 
 
 
483 aa  192  8e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  36.78 
 
 
496 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  36.05 
 
 
482 aa  192  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0503  leucyl aminopeptidase  37.88 
 
 
501 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  37.84 
 
 
496 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  37.39 
 
 
497 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3539  leucyl aminopeptidase  41.56 
 
 
525 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0102895 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  36.95 
 
 
500 aa  191  2e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  37.95 
 
 
498 aa  192  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  37.15 
 
 
495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1466  Leucyl aminopeptidase  37.92 
 
 
490 aa  190  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  37.92 
 
 
500 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  38.61 
 
 
496 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  36.82 
 
 
491 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  38.61 
 
 
496 aa  189  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  37.85 
 
 
499 aa  189  1e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  37.29 
 
 
483 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  38.01 
 
 
497 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  39.88 
 
 
496 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15490  leucyl aminopeptidase  38.59 
 
 
493 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.191096  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1187  Leucyl aminopeptidase  38.41 
 
 
496 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0133955  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  40.13 
 
 
495 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2646  Leucyl aminopeptidase  33.88 
 
 
507 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  40.25 
 
 
496 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  36.81 
 
 
503 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  37.81 
 
 
497 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8418  Leucyl aminopeptidase  35.22 
 
 
491 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00871794  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  38.57 
 
 
488 aa  186  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  39.1 
 
 
499 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3016  leucyl aminopeptidase  36.78 
 
 
479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  36.45 
 
 
542 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  36.93 
 
 
496 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  40.07 
 
 
496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  37.73 
 
 
500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  38.96 
 
 
497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  37.07 
 
 
497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  35.9 
 
 
494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  36.64 
 
 
503 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  37.74 
 
 
497 aa  183  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  36.2 
 
 
493 aa  183  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  38.34 
 
 
497 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  36.81 
 
 
500 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  36.34 
 
 
503 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  35.98 
 
 
498 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  38.34 
 
 
497 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  36.94 
 
 
503 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  37.27 
 
 
493 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  36.94 
 
 
503 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  36.64 
 
 
503 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  37.75 
 
 
536 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  36.64 
 
 
503 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1364  Leucyl aminopeptidase  38.38 
 
 
492 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  36.64 
 
 
503 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  36.34 
 
 
503 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  37.42 
 
 
497 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  38.14 
 
 
514 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4956  cytosol aminopeptidase family protein  33.44 
 
 
453 aa  180  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2408  PepA aminopeptidase  34.34 
 
 
507 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.729851  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  37.58 
 
 
503 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1271  leucyl aminopeptidase  38.05 
 
 
502 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.609468  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  37.58 
 
 
503 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  37.58 
 
 
503 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  37.25 
 
 
503 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  37.58 
 
 
503 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  37.58 
 
 
503 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2116  leucyl aminopeptidase  35.9 
 
 
479 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  36.04 
 
 
508 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  38.05 
 
 
512 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  37.58 
 
 
503 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  37.14 
 
 
487 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  39.43 
 
 
489 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  36.71 
 
 
489 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>