43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0238 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0238    100 
 
 		 1393 bp  2761    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0795  Protein-N(pi)-phosphohistidine-- sugarphosphotran sferase  80.84 
 
 		 1236 bp  77.8  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2832  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  89.06 
 
 		 1770 bp  71.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3514  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  89.06 
 
 		 1275 bp  71.9  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6151  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  89.06 
 
 		 1770 bp  71.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2739  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  85.9 
 
 		 1764 bp  67.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0296  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  82.2 
 
 		 1767 bp  67.9  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.881602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2881  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  85.9 
 
 		 1758 bp  67.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0482  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  85.71 
 
 		 1791 bp  65.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2620  phosphotransferase system, glucose-specific IIBC component  87.69 
 
 		 2130 bp  65.9  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00210    85.71 
 
 		 1185 bp  65.9  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16900  glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific phosphotransferase system IIC component  85.71 
 
 		 1293 bp  65.9  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.137948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1459  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  91.67 
 
 		 1977 bp  63.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0104386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1733  phosphotransferase system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  93.18 
 
 		 1491 bp  63.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0937959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1423  Protein-N(pi)-phosphohistidine-- sugarphosphotran sferase  87.5 
 
 		 1341 bp  63.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2821  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  84.62 
 
 		 1770 bp  60  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411205  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15380  glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific phosphotransferase system IIC component  87.93 
 
 		 1269 bp  60  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420514  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2207  phosphotransferase system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  84.62 
 
 		 1770 bp  60  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00438569  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0564  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  86.15 
 
 		 1776 bp  58  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.499479  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5260  Protein-N(pi)-phosphohistidine-- sugarphosphotran sferase  82.95 
 
 		 1299 bp  56  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0772  PTS system N-acetyl glucosamine specific transporter subunits IIABC  89.58 
 
 		 1947 bp  56  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4152  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  85.94 
 
 		 1788 bp  56  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0308  PTS system, glucose-like IIB subunint  90.91 
 
 		 1977 bp  56  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0571  PTS system N-acetyl glucosamine specific transporter subunits IIABC  94.29 
 
 		 1947 bp  54  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0705  PTS system N-acetyl glucosamine specific transporter subunits IIABC  94.29 
 
 		 1947 bp  54  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000288782  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2977  PTS system N-acetyl glucosamine specific transporter subunits IIABC  94.29 
 
 		 1947 bp  54  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2958  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  94.29 
 
 		 1947 bp  54  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0723  PTS system N-acetyl glucosamine specific transporter subunits IIABC  94.29 
 
 		 1947 bp  54  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0295  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  89.13 
 
 		 1806 bp  52  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0450  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIABC component  88 
 
 		 1770 bp  52  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.286084  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2874  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  87.76 
 
 		 1767 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.463572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0555  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  87.76 
 
 		 1761 bp  50.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.723185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0538  pts system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  87.76 
 
 		 1761 bp  50.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1446  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  87.76 
 
 		 1767 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0142  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  87.76 
 
 		 1767 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.823493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15780  PTS system N-acetylglucosamine-specific IIBC component  87.76 
 
 		 1713 bp  50.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000797276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2412  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  83.12 
 
 		 1689 bp  50.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0724  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIABC component  87.76 
 
 		 1767 bp  50.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.656695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3172  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIABC component  87.76 
 
 		 1767 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1228  PTS system N-acetyl glucosamine specific transporter subunits IIABC  93.94 
 
 		 1947 bp  50.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.182108  normal  0.10117 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00627  hypothetical protein  93.75 
 
 		 1947 bp  48.1  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.637174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8111  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  85.71 
 
 		 1320 bp  48.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.75222  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00636  fused N-acetyl glucosamine specific PTS enzyme: IIC, IIB, and IIA components  93.75 
 
 		 1947 bp  48.1  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.794808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>