14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1614 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1614  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  300  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1662  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  300  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0657  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4679  hypothetical protein  44.29 
 
 		 222 aa  125  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5468  hypothetical protein  36.62 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3365  hypothetical protein  34.06 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3787  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1894  hypothetical protein  30.17 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3936  hypothetical protein  30.92 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1228  hypothetical protein  29.08 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1884  hypothetical protein  34.53 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7150  hypothetical protein  34.55 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0280  hypothetical protein  32.31 
 
 		 157 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3540  hypothetical protein  28.91 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>