17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4679 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4679  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  457  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0657  hypothetical protein  45.65 
 
 		 153 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970518  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1614  hypothetical protein  44.29 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1662  hypothetical protein  44.29 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5468  hypothetical protein  32.86 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3936  hypothetical protein  27.27 
 
 		 166 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3365  hypothetical protein  24.83 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3787  hypothetical protein  24 
 
 		 156 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1894  hypothetical protein  31.45 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3099  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3716  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1363  hypothetical protein  25.5 
 
 		 159 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6233  hypothetical protein  26.14 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7012  hypothetical protein  26.14 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1228  hypothetical protein  29.55 
 
 		 167 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3540  hypothetical protein  28.48 
 
 		 158 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0280  hypothetical protein  24.22 
 
 		 157 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1884  hypothetical protein  23.89 
 
 		 161 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>