16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1884 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1884  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  332  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1228  hypothetical protein  43.2 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3716  hypothetical protein  34.88 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0657  hypothetical protein  30.91 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970518  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3787  hypothetical protein  33.67 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3365  hypothetical protein  33.67 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1614  hypothetical protein  34.53 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1662  hypothetical protein  34.53 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3936  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0280  hypothetical protein  27.27 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6233  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7012  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1894  hypothetical protein  28.79 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1363  hypothetical protein  25.64 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4679  hypothetical protein  23.89 
 
 		 222 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>