19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5468 on replicon NC_010721
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010721  Mpop_5468  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  299  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1894  hypothetical protein  41.72 
 
 
156 aa  90.5  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3936  hypothetical protein  37.33 
 
 
166 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4679  hypothetical protein  32.86 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1614  hypothetical protein  36.62 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1662  hypothetical protein  36.62 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1228  hypothetical protein  37.01 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0657  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970518  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6233  hypothetical protein  32.8 
 
 
160 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7012  hypothetical protein  33.6 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3540  hypothetical protein  35.82 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1363  hypothetical protein  30.3 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1884  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3716  hypothetical protein  33.77 
 
 
163 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0280  hypothetical protein  39.13 
 
 
157 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2417  hypothetical protein  39.02 
 
 
246 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3365  hypothetical protein  29.45 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3787  hypothetical protein  28.77 
 
 
156 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0865  hypothetical protein  30.16 
 
 
162 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>