19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3936 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3936  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  333  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5468  hypothetical protein  37.33 
 
 		 147 aa  89  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0865  hypothetical protein  34.97 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1363  hypothetical protein  32.91 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0280  hypothetical protein  34.78 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1894  hypothetical protein  34.62 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4679  hypothetical protein  27.27 
 
 		 222 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3716  hypothetical protein  28.66 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6233  hypothetical protein  32.56 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0657  hypothetical protein  32.56 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970518  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3365  hypothetical protein  30.43 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3787  hypothetical protein  29.71 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1662  hypothetical protein  30.92 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1614  hypothetical protein  30.92 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7012  hypothetical protein  31.78 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3540  hypothetical protein  31.78 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1884  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1228  hypothetical protein  31.08 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2417  hypothetical protein  28.41 
 
 		 246 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>