21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1894 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1894  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3099  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5468  hypothetical protein  41.72 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0280  hypothetical protein  39.24 
 
 		 157 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1363  hypothetical protein  35.67 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3936  hypothetical protein  34.62 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3716  hypothetical protein  38.71 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6233  hypothetical protein  32 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7012  hypothetical protein  31.2 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1614  hypothetical protein  31.65 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1662  hypothetical protein  31.65 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4679  hypothetical protein  31.58 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0657  hypothetical protein  34.03 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0865  hypothetical protein  31.41 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1228  hypothetical protein  28.69 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3540  hypothetical protein  31.94 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1884  hypothetical protein  30.82 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1364  hypothetical protein  27.1 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2417  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0866  hypothetical protein  26.67 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3365  hypothetical protein  32.94 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3787  hypothetical protein  30.59 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>