17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3540 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3540  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7012  hypothetical protein  70.99 
 
 
160 aa  234  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6233  hypothetical protein  70.99 
 
 
160 aa  234  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1363  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  90.5  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0280  hypothetical protein  37.5 
 
 
157 aa  87.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0865  hypothetical protein  37.66 
 
 
162 aa  87  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2417  hypothetical protein  38.18 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3716  hypothetical protein  36.71 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5468  hypothetical protein  37.78 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1894  hypothetical protein  32 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3936  hypothetical protein  31.78 
 
 
166 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1228  hypothetical protein  31.96 
 
 
167 aa  51.2  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4679  hypothetical protein  28.48 
 
 
222 aa  48.5  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0281  hypothetical protein  26.49 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1662  hypothetical protein  28.91 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1614  hypothetical protein  28.91 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0657  hypothetical protein  29.51 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>