22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0280 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0280  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  320  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1363  hypothetical protein  66.67 
 
 		 159 aa  230  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0865  hypothetical protein  53.55 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3716  hypothetical protein  52.17 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2417  hypothetical protein  45.95 
 
 		 246 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1364  hypothetical protein  36.36 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.386904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6233  hypothetical protein  35.67 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7012  hypothetical protein  35.03 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1894  hypothetical protein  39.37 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3936  hypothetical protein  34.78 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3540  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1228  hypothetical protein  37.61 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0866  hypothetical protein  30.82 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0281  hypothetical protein  29.61 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3787  hypothetical protein  33.72 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5468  hypothetical protein  39.13 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3365  hypothetical protein  32.56 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1884  hypothetical protein  27.27 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0657  hypothetical protein  26.72 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.970518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4679  hypothetical protein  24.22 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.768323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1662  hypothetical protein  32.31 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1614  hypothetical protein  32.31 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>