20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0294 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0294  photosystem II manganese-stabilizing polypeptide  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1843  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  59.71 
 
 		 273 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1898  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  58.84 
 
 		 277 aa  346  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4391  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  60.36 
 
 		 275 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0737033  hitchhiker  0.0000006576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4328  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  60.36 
 
 		 275 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3917  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  59.64 
 
 		 278 aa  336  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4931  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  58.33 
 
 		 275 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0507824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0497  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  58.76 
 
 		 274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2045  photosystem II manganese-stabilizing polypeptide  56.83 
 
 		 275 aa  294  9e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0299  photosystem II manganese-stabilizing polypeptide  55.77 
 
 		 276 aa  286  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03081  photosystem II manganese-stabilizing protein  46.01 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.994229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1597  photosystem II manganese-stabilizing protein  46.01 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02501  photosystem II manganese-stabilizing protein  45.05 
 
 		 262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02601  photosystem II manganese-stabilizing protein  44.69 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.544555  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02491  photosystem II manganese-stabilizing protein  44.32 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.896958  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23851  photosystem II manganese-stabilizing protein  43.71 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0230  photosystem II manganese-stabilizing protein  44.32 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29311  psbO, PSII-O, OEE1, photosystem II polypeptide, oxygen evolving enhancer 1  43.89 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.678993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02501  photosystem II manganese-stabilizing protein  44.32 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.785756  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20331  oxygen-evolving enhancer protein 1 precursor  44.83 
 
 		 308 aa  185  6e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>