20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2045 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2045  photosystem II manganese-stabilizing polypeptide  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0299  photosystem II manganese-stabilizing polypeptide  88.04 
 
 		 276 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0294  photosystem II manganese-stabilizing polypeptide  57.19 
 
 		 277 aa  310  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3917  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  50 
 
 		 278 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02501  photosystem II manganese-stabilizing protein  52.21 
 
 		 262 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02601  photosystem II manganese-stabilizing protein  52.57 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.544555  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02491  photosystem II manganese-stabilizing protein  51.84 
 
 		 279 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.896958  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4391  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  49.64 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0737033  hitchhiker  0.0000006576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4328  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  49.64 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0230  photosystem II manganese-stabilizing protein  50.74 
 
 		 264 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4931  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  49.46 
 
 		 275 aa  255  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0507824 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02501  photosystem II manganese-stabilizing protein  51.47 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.785756  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23851  photosystem II manganese-stabilizing protein  49.47 
 
 		 279 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1898  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  47.1 
 
 		 277 aa  245  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0497  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  46.74 
 
 		 274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1843  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  47.1 
 
 		 273 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03081  photosystem II manganese-stabilizing protein  46.18 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.994229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1597  photosystem II manganese-stabilizing protein  46.18 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29311  psbO, PSII-O, OEE1, photosystem II polypeptide, oxygen evolving enhancer 1  37.66 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.678993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20331  oxygen-evolving enhancer protein 1 precursor  38.21 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>