20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0299 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0299  photosystem II manganese-stabilizing polypeptide  100 
 
 		 276 aa  563  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2045  photosystem II manganese-stabilizing polypeptide  88.04 
 
 		 275 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0294  photosystem II manganese-stabilizing polypeptide  55.2 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02501  photosystem II manganese-stabilizing protein  53.11 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3917  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  49.46 
 
 		 278 aa  265  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4391  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  49.1 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0737033  hitchhiker  0.0000006576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4328  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  49.1 
 
 		 275 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4931  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  49.82 
 
 		 275 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0507824 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02601  photosystem II manganese-stabilizing protein  52.75 
 
 		 264 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.544555  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23851  photosystem II manganese-stabilizing protein  50.88 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1843  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  49.46 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02491  photosystem II manganese-stabilizing protein  52.01 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.896958  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0230  photosystem II manganese-stabilizing protein  50.55 
 
 		 264 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1898  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  48.01 
 
 		 277 aa  248  8e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0497  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  47.29 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02501  photosystem II manganese-stabilizing protein  51.65 
 
 		 279 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.785756  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03081  photosystem II manganese-stabilizing protein  45.62 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.994229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1597  photosystem II manganese-stabilizing protein  45.62 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29311  psbO, PSII-O, OEE1, photosystem II polypeptide, oxygen evolving enhancer 1  40.17 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.678993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20331  oxygen-evolving enhancer protein 1 precursor  37.65 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>