20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4931 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4931  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0507824 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4391  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  78.99 
 
 		 275 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0737033  hitchhiker  0.0000006576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4328  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  78.99 
 
 		 275 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1843  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  66.06 
 
 		 273 aa  388  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1898  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  64.49 
 
 		 277 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3917  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  59.06 
 
 		 278 aa  340  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0294  photosystem II manganese-stabilizing polypeptide  58.33 
 
 		 277 aa  335  5.999999999999999e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0497  photosystem II manganese-stabilizing protein PsbO  56 
 
 		 274 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0299  photosystem II manganese-stabilizing polypeptide  49.82 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2045  photosystem II manganese-stabilizing polypeptide  49.46 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29311  psbO, PSII-O, OEE1, photosystem II polypeptide, oxygen evolving enhancer 1  47.74 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.678993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20331  oxygen-evolving enhancer protein 1 precursor  42.69 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03081  photosystem II manganese-stabilizing protein  41.3 
 
 		 267 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.994229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1597  photosystem II manganese-stabilizing protein  41.3 
 
 		 267 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02501  photosystem II manganese-stabilizing protein  39.93 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23851  photosystem II manganese-stabilizing protein  38.11 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02601  photosystem II manganese-stabilizing protein  39.78 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.544555  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02491  photosystem II manganese-stabilizing protein  39.07 
 
 		 279 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.896958  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0230  photosystem II manganese-stabilizing protein  37.99 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02501  photosystem II manganese-stabilizing protein  38.71 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.785756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>