22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0154 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0154  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.111648  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0700  PAP fibrillin family protein  47.64 
 
 
193 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0467  PAP fibrillin family protein  46.35 
 
 
197 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1723  PAP fibrillin family protein  45.83 
 
 
197 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1747  PAP fibrillin family protein  45.31 
 
 
197 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1269  PAP fibrillin  44.79 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4591  PAP fibrillin  43.16 
 
 
194 aa  165  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100062  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3892  PAP fibrillin family protein  42.41 
 
 
193 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1969  PAP fibrillin  35.56 
 
 
212 aa  101  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.125177  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3872  PAP fibrillin  33.53 
 
 
208 aa  91.7  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.688678  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0980  PAP fibrillin family protein  32.22 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.215355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1485  PAP fibrillin family protein  30.56 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1513  PAP fibrillin family protein  30.56 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29825  predicted protein  25.93 
 
 
242 aa  64.7  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47358  predicted protein  25.42 
 
 
277 aa  52.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16899  predicted protein  33.61 
 
 
190 aa  48.9  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00359176  normal  0.0873946 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26276  predicted protein  50 
 
 
244 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29582  normal  0.0668637 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12331  hypothetical protein  25.69 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48066  predicted protein  27.12 
 
 
293 aa  45.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.743882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3166  hypothetical protein  25.4 
 
 
250 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11101  hypothetical protein  28.28 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11091  hypothetical protein  24.42 
 
 
180 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.479652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>