27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0467 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0467  PAP fibrillin family protein  100 
 
 
197 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1723  PAP fibrillin family protein  75.9 
 
 
197 aa  318  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1747  PAP fibrillin family protein  75.38 
 
 
197 aa  317  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4591  PAP fibrillin  60.62 
 
 
194 aa  256  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100062  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1269  PAP fibrillin  61.14 
 
 
194 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.244776  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0700  PAP fibrillin family protein  60.62 
 
 
193 aa  250  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3892  PAP fibrillin family protein  58.95 
 
 
193 aa  234  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0154  hypothetical protein  46.35 
 
 
205 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.111648  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1969  PAP fibrillin  40.59 
 
 
212 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.125177  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3872  PAP fibrillin  36.42 
 
 
208 aa  101  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.688678  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0980  PAP fibrillin family protein  34.91 
 
 
214 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.215355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1513  PAP fibrillin family protein  34.46 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1485  PAP fibrillin family protein  35 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29825  predicted protein  29.1 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12331  hypothetical protein  30.61 
 
 
187 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1028  hypothetical protein  31.46 
 
 
169 aa  55.1  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333335  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43886  predicted protein  26.07 
 
 
272 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47358  predicted protein  25.82 
 
 
277 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16899  predicted protein  32.2 
 
 
190 aa  52.4  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00359176  normal  0.0873946 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11101  hypothetical protein  28.89 
 
 
180 aa  51.2  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48066  predicted protein  26.07 
 
 
293 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.743882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3166  hypothetical protein  25.57 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13281  hypothetical protein  25.38 
 
 
179 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.062463 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11091  hypothetical protein  27.65 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.479652  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0561  hypothetical protein  26.83 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.690786  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_6260  predicted protein  26.01 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.211759  hitchhiker  0.00528048 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6312  predicted protein  26.01 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0117429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>